Progimnazija yra aktyvi Vilniaus miesto ir Lietuvos švietimo įstaigų bendruomenės narė ir partnerė. Bendradarbiaujame su Baltupių akademinio miestelio mokymosi įstaigomis:
- Mykolo Romerio universitetu;
- Vilniaus kolegijos menų ir kūrybinių technologijų fakultetu ir Vilniaus paslaugų verslo darbuotojų profesinio rengimo centru.
Socialiniai partneriai:
- Nacionalinė švietimo agentūra;
- Lietuvos progimnazijų asociacija;
- Vilniaus vaikų lopšelis-darželis „Gintarėlis”;
- Vilniaus lopšelis-darželis „Šermukšnėlė”;
- Vilniaus paslaugų verslo darbuotojų profesinio mokymo centras;
- Vilniaus Žirmūnų gimnazija;
- Vilniaus Šv. Kristoforo gimnazija;
- Vilniaus Tuskulėnų gimnazija;
- Vilniaus Fabijoniškių gimnazija;
- Vilniaus Senvagės gimnazija;
- A. Kulviečio klasikinė gimnazija;
- Vilniaus P. Vileišio progimnazija;
- Vilniaus Jeruzalės progimnazija;
- Vilniaus B. Radvilaitės progimnazija;
- Vilniaus Žemynos progimnazija;
- Vilniaus E. Pliaterytės progimnazija;
- Riešės gimnazija;
- Vilniaus kolegijos menų ir kūrybinių technologijų fakultetas, pedagogikos fakultetas;
- Mykolo Romerio universitetas;
- Vilniaus universitetas;
- Vytauto Didžiojo universitetas;
- „Robotikos akademija“;
- Vilniaus jaunųjų turistų centras;
- Vilniaus miesto savivaldybės Švietimo aplinkos skyrius;
- Specialiosios pedagogikos ir psichologijos centras;
- Vilniaus miesto pedagoginė psichologinė tarnyba;
- Sutrikusios raidos vaikų konsultavimo skyrius;
- Vilniaus apskrities VPK 1 14 Policijos komisariatas;
- Vilniaus miesto Vaiko teisių apsaugos skyriaus Pagalbos vaikui organizavimo poskyris;
- Vilniaus arkivyskupijos Caritas Motinos ir vaiko namai;
- Verkių seniūnija;
- Vilniaus pažangos švietimo centras;
- Antakalnio ligoninė;
- Lietuvos radijas ir televizija (su mokyklos radiju);
- Sporto klubas „Budora“;
- Muzikos mokykla „Yamaha“;
- Vilniaus miesto logopedų ir specialiųjų pedagogų metodinis būrelis;
- Vilniaus Gedimino technikos universiteto laboratorija Linkmenų fabrikas;
- Vilniaus miesto socialinės paramos centras;
- Lietuvos nacionalinė Martyno Mažvydo biblioteka;
- Vilniaus apskrities viešoji Adomo Mickevičiaus biblioteka;
- Lietuvos audiosensorinė biblioteka;
- Tauragės pagalbos mokiniui ir mokytojui centras.
Pasirašytos bendradarbiavimo sutartys su:
- „Šatrijos“ klubu;
- Vilniaus sporto mokykla „Tauras“;
- Vilniaus krepšinio mokykla;
- Babtų medelynu.